Contexte. Les agents pathogènes multirésistants et producteurs de biofilm représentent un défi majeur pour la santé publique mondiale, contribuant à des infections persistantes et difficiles à traiter. L’objectif de cette étude était de caractériser un métabolite actif produit par une nouvelle souche halothermophile de Streptomyces sp. CBN-1 présentant de fortes activités antibactérienne et antibiofilm, à l’aide d’une approche combinant analyses in silico et expérimentales. Méthodes et résultats. La souche halothermophile Streptomyces sp. CBN-1, capable de croître en présence de 10% de NaCl à 40°C, a été sélectionnée. Son identification, fondée sur des caractères phénotypiques et le séquençage du gène 16S rRNA, a permis de l’associer à Streptomyces rochei NRRL B-2410, avec une similarité de 99,15%. Un métabolite actif, nommé CBNa-1, a été extrait à partir d’un milieu ISP2 par solvant n-butanol et purifié par HPLC. Sa caractérisation structurale par spectrométrie de masse à ionisation électrospray et par RMN a révélé qu’il s’agissait d’un composé aromatique hétérocyclique régulé par des gènes codant une synthétase de peptides non ribosomiques (NRPS) et une polyketide synthase de type II (PKS). CBNa-1 a montré une activité marquée avec des concentrations minimales inhibitrices (CMI) comprises entre 4 et 5 µg/mL et des concentrations inhibitrices du biofilm (MBIC₅₀%) correspondant à la moitié de la CMI. Les analyses de docking in silico ont mis en évidence de fortes affinités de liaison (-8,7 à -8,1 kcal/mol) entre CBNa-1 et plusieurs cibles - isoleucyl-ARNt synthétase, glucosamine-6-phosphate synthase, protéine liant la pénicilline 1a, topoisomérases II et systèmes de quorum sensing - supérieures à celles observées avec des antibiotiques de référence (-5,7 à -7,9 kcal/mol). Les simulations de dynamique moléculaire ont confirmé la stabilité du complexe protéine-ligand dans des conditions physiologiques.
Driche EH, Badji B, Pont F, Zitouni A. In-vitro and in-silico antibacterial and antibiofilm activities of an aromatic heterocyclic metabolite from a novel halo-thermophilic Streptomyces sp. strain CBN-1 against bacteria causing nosocomial infections. Mol Biol Rep. 2025;52(1):529. Doi : 10.1007/s11033-025-10644-7.