Mycobactéries atypiques, pathogènes opportunistes hydriques en émergence

Atypical mycobacteria, opportunistic waterborne emerging pathogenes

bastien baud

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Laboratoire de bactériologie – Centre hospitalier universitaire (CHU) de Montpellier – 371, avenue du Doyen Gaston Giraud – 34000 Montpellier – France – Unité mixte de recherche Maladies infectieuses et vecteurs : écologie, génétique, évolution et contrôle (UMR MiVEGEC) – Institut de recherche pour le développement (IRD) – Centre national de la recherche scientifique (CNRS) – Université de Montpellier – Montpellier – France
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sara romano-bertrand

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Service de prévention des infections et de l’antibiorésistance – CHU de Montpellier – Montpellier – France - Équipe Pathogènes hydriques, santé, environnements – Unité mixte de recherche 5151 HydroSciences Montpellier – Unité de bactériologie – Unité de formation et de recherche des sciences pharmaceutiques et biologiques – Université de Montpellier – Montpellier – France
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jean-winoc decousser

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Équipe opérationnelle d’hygiène – Hôpitaux universitaires Henri-Mondor – Assistance publique-Hôpitaux de Paris – Créteil – France - Équipe d’accueil 7380 Dynamyc – Université Paris-Est Créteil – Faculté de médecine de Créteil – École nationale vétérinaire d’Alfort – Créteil – France
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bruno pozzetto

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Service des agents infectieux et d’hygiène – Hôpital Nord – CHU de Saint-Étienne – Saint-Étienne – France
- Groupe sur l’immunité des muqueuses et agents pathogènes (Gimap) – Centre international de recherche en infectiologie (Ciri) – Université Claude-Bernard-Lyon-1 – Institut national de la santé et de la recherche médicale (Inserm) U1111 – Unité mixte de recherche 5308 – Centre national de la recherche scientifique (CNRS) – École normale supérieure de Lyon – Université Jean-Monnet de Saint-Étienne – Saint-Étienne – France
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sylvain godreuil

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Laboratoire de bactériologie – Centre hospitalier universitaire (CHU) de Montpellier – Montpellier – France
- Unité mixte de recherche Maladies infectieuses et vecteurs : écologie, génétique, évolution et contrôle (UMR MiVEGEC) – Institut de recherche pour le développement (IRD) – Centre national de la recherche scientifique (CNRS) – Université de Montpellier – Montpellier – France
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chloé dupont

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Laboratoire de bactériologie – Centre hospitalier universitaire (CHU) de Montpellier – Montpellier – France
- Unité mixte de recherche Maladies infectieuses et vecteurs : écologie, génétique, évolution et contrôle (UMR MiVEGEC) – Institut de recherche pour le développement (IRD) – Centre national de la recherche scientifique (CNRS) – Université de Montpellier – Montpellier – France
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Mycobactéries atypiques, pathogènes opportunistes hydriques en émergence

Figures

Résumé

Les mycobactéries non tuberculeuses (MNT) sont des bacilles acido-alcoolo-résistants distincts de Mycobacterium tuberculosis et Mycobacterium leprae, de plus en plus impliqués en pathologie humaine. Leur paroi riche en acides mycoliques leur confère une résistance aux acides, alcools et à certains antiseptiques. Les MNT sont ubiquitaires, présentes dans les milieux aquatiques, les sols et les réseaux d’eau domestiques et hospitaliers. Ce sont des pathogènes opportunistes d’où la nécessité de distinguer colonisation et infection. Le diagnostic d’infection est complexe et basé sur des critères cliniques, radiologiques et microbiologiques. Quelques espèces dominent les infections humaines : le complexe Mycobacterium avium (MAC), Mycobacterium xenopi, puis des mycobactéries à croissance rapide comme Mycobacterium abscessus ou  Mycobacterium fortuitum/chelonae. Cliniquement, les atteintes sont surtout pulmonaires, mais peuvent aussi être cutanées, lymphatiques, ostéo-articulaires ou disséminées. En milieu hospitalier, les patients immunodéprimés ou exposés à des dispositifs invasifs sont particulièrement à risque, et des épidémies nosocomiales liées à l’eau et aux dispositifs médicaux ont été décrites dans la littérature. Lors de la survenue d’infections et épidémies nosocomiales, des investigations environnementales doivent être réalisées mais sont techniquement difficiles (méthode de décontamination, choix des milieux de culture, volumes d’eau à prélever, incubation à 30 °C). Le traitement recommandé pour les infections à MAC associe une rifamycine, de l’éthambutol et un macrolide, parfois en association avec un aminoside, pour des durées souvent >6-12 mois. Ce traitement long et complexe, expose au risque d’émergence de résistances, et la détection génotypique des résistances (macrolides, aminosides) est recommandée. Ces pathogènes nécessitent donc une vigilance diagnostique, une surveillance des dispositifs médicaux et la mise en place de protocoles d’investigation adaptés pour prévenir les infections et épidémies.

Mots clés: Mycobactéries non tuberculeuses - Dispositifs médicaux - Réseaux hydriques - Investigations environnementales - Épidémies nosocomiales

Abstract

Non-tuberculous mycobacteria (NTM) are acid- and alcohol-resistant bacilli distinct from Mycobacterium tuberculosis and Mycobacterium leprae, increasingly involved in human infectious diseases. Their cell wall, rich in mycolic acids, confers resistance to acids, alcohols and antiseptics. NTM are ubiquitous, found in aquatic environments, soil and domestic and hospital water systems. NTM are opportunistic pathogens, hence the need to distinguish colonisation from infection. Diagnosis of infection is complex and relies on clinical, radiological and microbiological criteria. A few species dominate human infections: the Mycobacterium avium complex (MAC), Mycobacterium xenopi, and rapid-growing mycobacteria such as Mycobacterium abscessus and the Mycobacterium fortuitum / chelonae group. Clinically, manifestations are mainly pulmonary but can also be cutaneous, lymphatic, osteoarticular or disseminated. In hospitals, immunocompromised patients or those exposed to invasive devices are at particular risk, and nosocomial outbreaks linked to water and medical devices have been reported. When nosocomial infections or outbreaks occur, environmental investigations should be carried out but are technically challenging (decontamination methods, choice of culture media, volumes of water to sample, incubation at 30 °C). Recommended treatment for NTM infections combines rifamycin, ethambutol and macrolide, sometimes with an aminoglycoside, for often prolonged durations >6–12 months. This long complex therapy carries a risk of emerging resistances, and genotypic detection of resistances (macrolides, aminoglycosides) is recommended. These pathogens require diagnostic vigilance, surveillance of medical devices and implementation of appropriate investigation protocols to prevent infections and outbreaks.

Keywords: Non-tuberculous mycobacteria - Medical devices - Water networks - Environmental investigations - Hospital-acquired outbreaks

Article

Citation

Baud B, Romano-Bertrand S, Decousser JW, Pozzetto B, Godreuil S, Dupont C. Mycobactéries atypiques, pathogènes opportunistes hydriques en émergence. Hygiènes. 2026;34(2):146-154.

HistoriqueReçu 24 avril 2026 – Accepté 28 avril 2026 – Publié 21 mai 2026

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