Quel délai pour une décolonisation intestinale des entérobactéries productrices de carbapénémases ?

What is the timeframe for intestinal decolonization of carbapenemase-producing enterobacterales?

noureddine henoun loukili

dr noureddine henoun loukili

Unité de lutte contre les infections nosocomiales (Ulin) – Hôpital Calmette – Centre hospitalier universitaire (CHU) de Lille – Boulevard du Professeur-Leclerc – 59000 Lille – France
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alexandre benaïche

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Ulin – Hôpital Calmette – CHU de Lille – Lille – France
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agnès perrin

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Ulin – Hôpital Calmette – CHU de Lille – Lille – France
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Quel délai pour une décolonisation intestinale des entérobactéries productrices de carbapénémases ?

Figures

Résumé

Contexte. La décolonisation intestinale des entérobactéries productrices de carbapénémases (EPC) est nécessaire pour lever les précautions complémentaires chez les patients porteurs hospitalisés. Cette étude évalue le délai de décolonisation et identifie les facteurs de risque associés. Méthode. Une étude de cohorte rétrospective a ciblé 110 patients porteurs intestinaux confirmés entre janvier 2018 et septembre 2020 dans un centre hospitalier universitaire. La décolonisation était validée par au moins trois prélèvements rectaux négatifs consécutifs sans résultat positif ultérieur. Une analyse de survie a été réalisée pour estimer le délai médian de décolonisation. Un modèle de Cox multivarié a été utilisé pour identifier les facteurs associés. Résultats. La décolonisation intestinale a été observée pour 27 patients (24,5%). Son délai médian a été estimé à 698 jours. En analyse univariée, le sexe féminin (p=0,046), la présence de plusieurs espèces d’EPC (p=0,005) et l’identification d’Escherichia coli (p=0,001) ou de Klebsiella spp. (p=0,028) dans le premier dépistage étaient significativement associés au délai de décolonisation. L’analyse multivariée a révélé que la présence d’E. coli EPC dans le premier dépistage ou d’une EPC avec une bêtalactamase à spectre étendu était significativement associée à un délai de décolonisation prolongé : hazard ratios ajustés respectifs de 0,13 (IC95 [0,04-0,45] ; p=0,001) et 0,34 (IC95 [0,12-0,90] ; p=0,031). Conclusion. La décolonisation intestinale des EPC peut nécessiter plusieurs mois voire années. Les E. coli producteurs de carbapénémases pourraient jouer un rôle central dans ce délai, probablement via des mécanismes de transfert horizontal de gènes entre espèces. La levée des précautions complémentaires chez les patients porteurs EPC doit donc être envisagée avec prudence.

Mots clés: Colonisation digestive - Entérobactérie - Bactérie Hautement Résistante Emergente - Précautions complémentaires - Résistance aux antibiotiques

Abstract

Background. Intestinal decolonization of carbapenemase-producing Enterobacterales (CPE) is required to discontinue contact precautions in hospitalized carrier patients. This study aimed to evaluate the time to decolonization and identify associated risk factors. Methods. A retrospective cohort study included 110 patients with confirmed intestinal CPE carriage between January 2018 and September 2020 in a university hospital. Decolonization was defined as at least three consecutive negative rectal swabs with no subsequent positive result. Survival analysis was performed to estimate the median time to decolonization. A multivariable Cox model was used to identify associated factors. Results. Intestinal decolonization was observed in 27 patients (24.5%), with a median time estimated at 698 days. In univariate analysis, female sex (p=0.046), carriage of multiple CPE species (p=0.005), and initial detection of Escherichia coli (p=0.001) or Klebsiella spp. (p=0.028) were significantly associated with the time to decolonization. Multivariate analysis showed that initial carriage of CPE E. coli or CPE with extended-spectrum β-lactamase production was significantly associated with prolonged decolonization times, with adjusted hazard ratios of 0.13 (95% CI [0.04-0.45]; p=0.001) and 0.34 (95% CI [0.12-0.90]; p=0.031), respectively. Conclusion. Intestinal decolonization of CPE may take several months or even years. E. coli producing carbapenemases may play a central role in this prolonged persistence, likely through horizontal gene transfer mechanisms between species. Discontinuation of contact precautions in CPE carriers should therefore be approached with caution.

Keywords: Digestive colonization - Enterobacteria - Emerging resistant bacteria - Complementary precautions - Antibiotic resistance

Article

Citation

Historique : Reçu 5 septembre 2025 – Accepté 29 octobre 2025 – Publié 15 janvier 2026.

Benaïche A, Perrin A, Henoun Loukili N. Quel délai pour une décolonisation intestinale des entérobactéries productrices de carbapénémases ? Hygiènes. 2025;33(5):458-465. Doi : 10.25329/hy_xxxiii_6_loukili.

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