Détection rapide des EPC : une comparaison de méthodes

Contexte. La prévalence croissante des entérobactéries productrices de carbapénémases (EPC) nécessite des outils diagnostiques fiables. Cette étude a évalué les performances du système VITEK2 Advanced Expert System (AES), un logiciel d’interprétation associé aux résultats d’antibiogramme VITEK2, pour la détection des EPC, ainsi que la capacité des règles expertes BIOART à identifier les différents types de carbapénémases. Méthodes. La sensibilité aux antibiotiques a été évaluée à l’aide du système VITEK2 (cartes N436 et XN28) et de la méthode de diffusion en gélose sur une collection de 244 isolats représentatifs de l’épidémiologie française, comprenant 145 EPC, 51 Enterobacterales résistantes aux carbapénèmes sans production de carbapénémase et 48 isolats sensibles aux carbapénèmes. Une règle spécifique dédiée aux producteurs d’OXA-244/OXA-484 a été évaluée sur une collection de 36 isolats producteurs de ces enzymes, réputés difficiles à détecter. Résultats. Les performances du couple VITEK2 N436/AES et de l’algorithme du Comité de l’antibiogramme de la Société française de microbiologie (CA-SFM) étaient comparables pour la détection des EPC, avec des sensibilités respectives de 93,8 % et 97,2 % et des spécificités de 53,5 % et 49,5 %. La majorité des erreurs de détection concernait les producteurs d’OXA-244/OXA-484. L’application de la règle spécifique dédiée à ces enzymes a permis d’atteindre une sensibilité de détection de 100 %. Les règles BIOART ont identifié la seule classe de carbapénémase présente, sans autre mécanisme de résistance rapporté, dans 83 cas ; la classe correcte associée à d’autres mécanismes dans 30 cas ; aucune classe de carbapénémase ou une classe incorrecte a été attribuée respectivement dans 6 et 5 cas. Douze isolats ne relevaient pas du champ d’application des règles BIOART (producteurs d’IMI ou producteurs de plusieurs carbapénémases). L’attribution correcte et unique de la classe de carbapénémase a été obtenue pour 97,5 % des producteurs de NDM, 54,5 % des producteurs d’enzymes de type OXA-48 et 57,1 % des producteurs de VIM. Tous les producteurs de KPC ont été correctement identifiés comme tels ; toutefois, un mécanisme d’imperméabilité aux carbapénèmes était systématiquement signalé en parallèle, empêchant une attribution unique et non ambiguë. Conclusion. La solution intégrée VITEK2 AES/BIOART constitue une approche efficace pour le dépistage et la classification des EPC, en particulier pour les producteurs de NDM et de KPC.

Emeraud C, Abad L, Crolet V, et al.

Evaluation of new expert rules for the detection and differentiation of carbapenemase-producing Enterobacterales within the French epidemiological context. J Clin Microbiol. 2026:e00222-26. Doi : 10.1128/jcm.00222-26.